MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY02

Total Repeats: 825

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009468	CCGGC	2	10	4888	4897	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2	NC_009468	GC	3	6	4920	4925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009468	GCG	2	6	4949	4954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009468	GCG	2	6	4990	4995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009468	CGC	2	6	5132	5137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_009468	CCA	2	6	5143	5148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_009468	CTC	2	6	5160	5165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_009468	GCCT	2	8	5193	5200	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009468	CAC	2	6	5275	5280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_009468	AAC	2	6	5320	5325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009468	GCC	2	6	5329	5334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_009468	ATCG	2	8	5340	5347	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009468	GCC	3	9	5355	5363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_009468	CG	3	6	5410	5415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009468	GCC	2	6	5446	5451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_009468	CTT	2	6	5457	5462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009468	CCG	2	6	5475	5480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_009468	TC	3	6	5486	5491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009468	GGCG	2	8	5505	5512	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009468	GAT	2	6	5546	5551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009468	ATG	2	6	5615	5620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009468	CGGG	2	8	5629	5636	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009468	CG	3	6	5662	5667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009468	CG	3	6	5700	5705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009468	T	6	6	5730	5735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009468	GCCC	2	8	5754	5761	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_009468	CGG	2	6	9531	9536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009468	CGC	2	6	12061	12066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_009468	GC	3	6	12889	12894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009468	GC	3	6	12898	12903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009468	GGC	2	6	12904	12909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009468	CAC	2	6	12913	12918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_009468	ATG	2	6	13002	13007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009468	ATG	2	6	13009	13014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009468	CGG	2	6	13027	13032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009468	CCG	2	6	13082	13087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_009468	AG	3	6	13239	13244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009468	CT	3	6	14335	14340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009468	CGGCTG	2	12	14353	14364	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009468	CGG	2	6	14366	14371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009468	TGCG	2	8	14407	14414	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009468	TGG	2	6	14454	14459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009468	GTGC	2	8	14460	14467	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009468	CGG	2	6	14492	14497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009468	CCG	2	6	14505	14510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_009468	GGTG	2	8	17749	17756	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009468	TTG	2	6	17776	17781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009468	CGG	2	6	17890	17895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009468	CCG	2	6	17910	17915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_009468	GGC	2	6	17977	17982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009468	TCC	2	6	18353	18358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_009468	ATCG	2	8	18412	18419	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009468	CTG	2	6	18440	18445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009468	CGA	2	6	18581	18586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009468	TCC	2	6	18592	18597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_009468	GCG	2	6	18600	18605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009468	CGT	2	6	18655	18660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009468	CTT	2	6	18724	18729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009468	CCA	2	6	18748	18753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_009468	AAC	2	6	18784	18789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009468	AGG	2	6	18836	18841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009468	GAT	2	6	18850	18855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009468	GGC	2	6	18888	18893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009468	CGCA	2	8	18959	18966	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009468	CCG	2	6	18973	18978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_009468	TCA	2	6	19000	19005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009468	TCC	2	6	20413	20418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_009468	CCCT	2	8	20446	20453	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
69	NC_009468	GCCC	2	8	20560	20567	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70	NC_009468	TGGG	2	8	20601	20608	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009468	CG	5	10	20736	20745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009468	CAT	2	6	20772	20777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009468	GT	3	6	20790	20795	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009468	CCA	2	6	20813	20818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_009468	AGTC	2	8	20830	20837	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009468	GGCC	2	8	20961	20968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009468	G	6	6	20994	20999	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009468	CCG	2	6	21005	21010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_009468	CGA	2	6	21025	21030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009468	C	8	8	24347	24354	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
81	NC_009468	CG	3	6	24416	24421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009468	GCGGT	2	10	24428	24437	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_009468	GACG	2	8	24449	24456	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009468	CG	3	6	24506	24511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009468	CGAC	2	8	24527	24534	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009468	GCT	2	6	24539	24544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009468	GCGG	2	8	25137	25144	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_009468	CGC	2	6	25189	25194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_009468	TCC	2	6	25231	25236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_009468	TCA	2	6	25266	25271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009468	A	6	6	25613	25618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009468	AGA	3	9	25646	25654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009468	CAA	2	6	25666	25671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_009468	ACGC	2	8	25691	25698	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_009468	TAT	2	6	26123	26128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009468	GGC	2	6	28898	28903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009468	TTG	2	6	28905	28910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009468	ACC	2	6	28932	28937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_009468	GAC	2	6	28993	28998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009468	ATA	2	6	29106	29111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009468	CGC	3	9	34765	34773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_009468	CCG	2	6	34961	34966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_009468	GGA	2	6	35009	35014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009468	CTC	2	6	35026	35031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_009468	AC	3	6	35036	35041	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_009468	CCG	2	6	35142	35147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_009468	GGA	2	6	35152	35157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009468	CGG	3	9	35204	35212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009468	TAC	2	6	35218	35223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009468	TGG	2	6	35331	35336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009468	GC	3	6	35398	35403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_009468	CGT	2	6	35473	35478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009468	GT	3	6	35541	35546	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009468	TCTA	2	8	35581	35588	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009468	T	6	6	35633	35638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009468	ATTG	2	8	35650	35657	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009468	CGC	2	6	35707	35712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_009468	GCTC	2	8	35773	35780	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009468	CGG	2	6	35831	35836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_009468	AGT	2	6	35844	35849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009468	GTG	2	6	35906	35911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009468	CCG	2	6	35935	35940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_009468	TGT	2	6	35964	35969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009468	GT	3	6	35968	35973	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009468	GCG	2	6	36005	36010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009468	C	6	6	36012	36017	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
127	NC_009468	CCG	2	6	36179	36184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_009468	GCA	2	6	36249	36254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_009468	AGG	2	6	36374	36379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009468	AG	3	6	36382	36387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009468	TCG	2	6	36427	36432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009468	TGT	2	6	36454	36459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009468	CGG	2	6	36546	36551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009468	GAA	2	6	36745	36750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009468	CGT	2	6	36790	36795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_009468	CCG	2	6	36850	36855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_009468	GCC	2	6	36986	36991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_009468	TG	3	6	37004	37009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009468	TCGC	2	8	37105	37112	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_009468	GGC	2	6	37113	37118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_009468	GCG	2	6	37175	37180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_009468	CGA	2	6	37603	37608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_009468	CGA	2	6	37643	37648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_009468	CA	4	8	37655	37662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_009468	CGA	2	6	37731	37736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_009468	ATCCAG	2	12	37791	37802	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_009468	GA	3	6	37839	37844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_009468	GCC	2	6	98671	98676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
435	NC_009468	TCC	2	6	98695	98700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
436	NC_009468	ACC	2	6	98713	98718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
437	NC_009468	GCC	2	6	98725	98730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
438	NC_009468	C	6	6	98790	98795	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
439	NC_009468	CG	3	6	98842	98847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
440	NC_009468	CG	3	6	98914	98919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
441	NC_009468	CGG	2	6	98950	98955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
442	NC_009468	TGG	2	6	98979	98984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
443	NC_009468	GAT	2	6	99037	99042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
444	NC_009468	AGCC	2	8	99071	99078	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
445	NC_009468	CCG	2	6	99097	99102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
446	NC_009468	CGG	2	6	99167	99172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
447	NC_009468	C	7	7	99194	99200	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
448	NC_009468	GTC	2	6	102624	102629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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450	NC_009468	TG	3	6	102877	102882	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
451	NC_009468	GTT	2	6	102911	102916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_009468	CAA	2	6	102945	102950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
454	NC_009468	ATCA	2	8	102975	102982	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
455	NC_009468	ATT	2	6	102999	103004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_009468	TTG	2	6	103046	103051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
457	NC_009468	CGCA	2	8	103073	103080	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
458	NC_009468	CATTG	2	10	103112	103121	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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463	NC_009468	CG	3	6	104239	104244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
464	NC_009468	GCG	2	6	104697	104702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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466	NC_009468	ACC	2	6	106013	106018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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469	NC_009468	TGG	2	6	106591	106596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
470	NC_009468	ATT	2	6	106597	106602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_009468	TGT	2	6	106622	106627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
472	NC_009468	TCT	2	6	106686	106691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
473	NC_009468	TGG	2	6	106831	106836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_009468	GC	3	6	107668	107673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
476	NC_009468	GAT	2	6	107675	107680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
477	NC_009468	GTT	2	6	107720	107725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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480	NC_009468	GGGCT	2	10	107893	107902	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
481	NC_009468	GCC	2	6	107924	107929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
482	NC_009468	TGA	2	6	108134	108139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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487	NC_009468	CGG	2	6	108346	108351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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491	NC_009468	ACA	2	6	108522	108527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
492	NC_009468	CCT	2	6	108528	108533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
493	NC_009468	TCGC	2	8	108559	108566	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
494	NC_009468	AGA	2	6	108567	108572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
495	NC_009468	TGGC	2	8	108581	108588	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
496	NC_009468	CGG	2	6	108627	108632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
497	NC_009468	CG	3	6	108655	108660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
498	NC_009468	TCG	2	6	108677	108682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
499	NC_009468	AGA	2	6	108717	108722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
500	NC_009468	CG	3	6	108757	108762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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